Kern-DNA erscheint nicht in freien linearen Strängen; es ist stark verdichtet und um Histone gewickelt, um in den Kern zu passen und an der Bildung von Chromosomen teilzunehmen.
Histone sind basische Proteine und ihre positive Ladung ermöglicht es ihnen, sich mit DNA zu assoziieren die negativ geladen ist. Einige Histone fungieren als Spulen, um die sich die fadenartige DNA wickeln kann.
Unter dem Mikroskop sieht Chromatin in seiner ausgedehnten Form wie Perlen an einer Schnur aus. Die Kügelchen werden Nukleosomen genannt. Jedes Nukleosom besteht aus DNA, die um acht Histonproteine gewickelt ist, die wie eine Spule funktionieren und als Histonoctamer bezeichnet werden. Jedes Histonoctamer besteht aus jeweils zwei Kopien der Histonproteine H2A, H2B, H3 und H4. Die Nukleosomenkette wird dann in eine 30-nm-Spirale gewickelt, die als Solenoid bezeichnet wird, wobei zusätzliche H1-Histonproteine mit jedem Nukleosom verbunden sind, um die Chromosomenstruktur aufrechtzuerhalten.